31 Temmuz 1974 tarihinde Mülga Gıda İşleri Genel Müdürlüğüne bağlı taşra teşkilatı olarak "Gıda Kontrol Eğitim ve Araştırma Enstitüsü Müdürlüğü" adı altında faaliyete geçmiş olan kuruluşumuzun 17 Kasım 1982 tarihinde "Gıda Kontrol ve Araştırma Enstitüsü Müdürlüğü" adını almış ve aynı ad altında Mart 1985 tarihinde İzmir İl Müdürlüğüne bağlı kuruluş haline gelmiştir. 1 Ekim 1986 tarihinde Tohumluk Kontrol ve Sertifikasyon İstasyonu Müdürlüğü ile birleşerek "İzmir İl Kontrol Laboratuar Müdürlüğü" adı altında faaliyetlerine yine İl Müdürlüğüne bağlı kuruluş olarak devam etmiş ve 16 Ocak 1995 tarihli Bakanlık Onayı ile Bakanlığa doğrudan bağlı kuruluş haline getirilmiştir.

İzmir İl Kontrol Laboratuvarı, gelişen teknolojiye uyum sağlayarak hizmet veren ve müşteri memnuniyetini esas tutan, eğitimli personeliyle on ana hizmet birimi ve iki yardımcı hizmet biriminden oluşan faaliyetlerini yürütmektedir.

17.01.1985 gün ve 18638 sayılı Resmi Gazetede yayımlanarak yürürlüğe giren Tarım Orman ve Köy İşleri Bakanlığı Taşra Teşkilatının Kuruluşu, Görevleri Çalışma Usul ve Esasları Hakkında Yönetmelik gereğince teşkil edilen "İzmir İl Müdürlüğüne" Bakanlığımız Araştırma Planlama ve Koordinasyon Kurulu Başkanlığının 25.02.1985 sayılı KDD/09/009/1161 sayılı genelgeleri gereğince "İzmir Gıda Kontrol ve Araştırma Enstitüsü" ile "Yem Kontrol ve Araştırma Enstitüsü" Müdürlükleri bağlanmışlardır. Tarım Orman ve Köy işleri Bakanlığı'nın teşkilat ve görevleri hakkındaki 12.03.1985 tarih ve 18692 sayılı Resmi Gazetede yayımlanan 3161 sayılı kanunun hükümleri gereğince faaliyetlerini sürdürmüşlerdir.

Bakanlığımız Araştırma Planlama ve Koordinasyon Kurulu Başkanlığının 12.08.1986 tarihli ve AİD/G-1/4179 sayılı yazıları gereğince, "İzmir Gıda Kontrol ve Araştırma Enstitüsü Müdürlüğü" ile "Yem Kontrol ve Araştırma Enstitüsü Müdürlüğü" birleştirilerek, "İzmir İl Kontrol Laboratuvar Müdürlüğü" kurulmuştur.

Bakanlık Makamının 04.06.1999 tarih ve 138 sayılı Olurları ile Müdürlüğümüz bünyesinde Ağustos 1997'den itibaren faaliyete geçmek üzere Döner Sermaye İşletmesi kurulmuş ve faaliyete geçmiştir.
Bakanlık Makamının 15.11.2000 tarih ve MKD BDR-2-06-2000 sayılı olurlarıyla ifa ettiği görev itibariyle Koruma ve Kontrol Genel Müdürlüğü ve Tarım İşletmeleri Genel Müdürlüğüne karşı sorumludur.